Projetos de pesquisa nacionais
Centro de Referência em Big Data - Projeto MultiLOD
Descrição: Este projeto se insere no primeiro ano de implantação do Centro de Referência em Big Data da UFRJ. O objetivo é investigar técnicas que poderão ser utilizadas na extração, preparação e transformação de grandes volumes de dados estruturados multimensionais para repositórios distribuídos de dados no formato RDF. Neste sentido será necessário investigar quais SGBDs, técnicas de distribuição e paralelização de dados em ambientes de nuvem, além de outros mecanismos para modelagem e tratamento de dados em estruturas de grafo, poderão ser utilizados de modo eficiente. No caso deste projeto, optou-se por priorizar dados de natureza multidimensional, a exemplo de dados estatísticos e dados de medidas em geral, por sua importância para áreas estratégicas como as áreas de governo e científica. As avaliações quantitativas levarão em consideração o desempenho de consultas SPARQL considerando-se processamento analíticos sobre esses dados. Como base para as experimentações, serão utilizados dados referentes a medidas de desempenho de rede do projeto Pinger (Souza 2013), desenvolvido originalmente em parceria com o Stanford Linear Aceleration Center (SLAC).
Período: 2015 – atual
Natureza: Pesquisa.
Financiador(es): EMC COMPUTER SYSTEMS BRASIL LTDA – Auxílio financeiro.
Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Sergio Manuel Serra da Cruz – Integrante / Maria Luiza Machado Campos – Coordenador / Adriana Santarosa Vivacqua – Integrante / Marcos Roberto da Silva Borges – Integrante.
Da genômica comparativa à filogenômica: desvendando a complexidade genômica e adaptações evolutivas de 32 espécies de protozoários
Descrição: A proposta visa o estudo das relações evolutivas de Protozoa em grande escala, fazendo uso de uma abordagem filogenômica (usando 32 espécies de Protozoa), inferindo as relações evolutivas (filoma) de todas as proteínas dos genomas dessas espécies. Dois objetivos principais podem ser destacados: 1) inferência da complexidade genômica e adaptações evolutivas para um estilo de vida parasitário, e 2) re-anotação semi-automática (baseada em filogenia e não apenas em similaridade) dos 32 genomas (22 disponíveis no GenBank e 10 a serem sequenciados) de Protozoa. A parte computacional do projeto utiliza computação em Nuvem para executar Workflows Científicos e realizar o tratamento dos dados utilizando técnicas de pertinentes ao domínio dos grandes volumes de dados biológicos.
Período: 2014 – atual
Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) .
Integrantes: Sergio Manuel Serra da Cruz – Integrante / Maria Luiza Machado Campos – Integrante / Alberto Martin Rivera Dávila – Coordenador / Rafael Cuadrat – Integrante / Glauber Wagner – Integrante / Christian M. Probst – Integrante / Antonio Basilio de Miranda – Integrante / Fabio Faria da Mota – Integrante / Renata Schama Lellis – Integrante / Rodrigo Jardim Monteiro da Fonseca – Integrante / Claudia M. dÀvila-Levy – Integrante / Jeronimo Cruz – Integrante / Roney Coimbra – Integrante / Fabrício Alves Silva – Integrante / Herbert Guedes – Integrante / Leonardo Koerich – Integrante / Edmundo Grisard – Integrante / Luiz C. Miletti – Integrante.
Manejo tecnológico de pragas e doenças em tomateiros do estado do Rio de Janeiro
Período: 2013 – atual
Natureza: Pesquisa.
Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ – Auxílio financeiro.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) .
Integrantes: Sergio Manuel Serra da Cruz – Coordenador / Robson Mariano da Silva – Integrante / Luiz Maltar de Castello Branco – Integrante / Márcio Nunes de Miranda – Integrante / Gizelle Kupac Vianna – Integrante / Diogo Nunes – Integrante / Carlos Werly – Integrante / Marden Manuel Marques – Integrante.
Uso de workflows científicos e ontologias em experimentos científicos baseados em grandes massas de dados metereológicos
Período: 2013 – atual
Natureza: Pesquisa.
Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ – Auxílio financeiro.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Sergio Manuel Serra da Cruz – Coordenador / Ednaldo Oliveira dos Santos – Integrante / Gustavo Bastos Lyra – Integrante / Robson Mariano da Silva – Integrante.
Projetos de pesquisa internacionais
Red Iberoamericana de Agro-Bigdata y 'Decision Support Systems' (DSS) Para Un Sector Agropecuario Sostenible
Período: 2016- atual
Natureza: Pesquisa.
Financiador(es): Programa Ibero-Americano de Ciencia y Tecnologia para el Desarrollo – Outra.
Integrantes: Sergio Manuel Serra da Cruz – Coordenador / Ana Claudia de Macedo Vieira – Integrante / Raimundo José Macário Costa – Integrante / Ednaldo Oliveira dos Santos – Integrante / André Luis A. Guimarães – Integrante / Lluis Miquel Pla Aragones – Integrante.
From Comparative Genomics to Phylogenomics: Uncovering the Genomic Complexity and Evolutionary Adaptations of Twenty Species of Protozoa
Período: 2015 – atual
Natureza: Pesquisa.
Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ – Cooperação / Research Council UK – Cooperação.
Integrantes: Sergio Manuel Serra da Cruz – Integrante / Maria Luiza Machado Campos – Coordenador / Alberto Martin Rivera Dávila – Integrante / Rodrigo Jardim – Integrante / Matt Clark – Integrante / Kevin Tyler – Integrante.
Red Iberoamericana de Logística Inteligente en la Gestión Sostenible del Transporte en Núcleos Urbanos
Descrição: Descrição do projeto e lista de componentes clique aqui.
Situação: Em andamento – 2015 .
Natureza: Pesquisa.
Financiador(es): Programa Ibero-Americano de Ciencia y Tecnologia para el Desarrollo – Auxílio financeiro.
Alunos envolvidos: Graduação: (12) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Sergio Manuel Serra da Cruz – Integrante / Ana Claudia de Macedo Vieira – Integrante / Raimundo José Macário Costa – Integrante / Laci Mary Barbosa Manhães – Integrante / André Luis A. Guimarães – Integrante / Fábio Cardozo da Silva – Integrante / FRANCISCO JAVIER FAULIN FAJARDO – Coordenador.
